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コンピュータのこととかのメモ。

山本 一彰 | Takaaki Yamamoto

山本一彰(Takaaki Yamamoto)

東京工業大学において計算機科学と応用数学を学び、 情報科学芸術大学院大学[IAMAS]においてメディア表現を専攻し修了。 2015年にコンビネータ論理を基に計算完備な計算手法 "論理珠算"を開発し、 それを含む体系である"算道"を構成した。 その成果により、2016年に 第19回 文化庁メディア芸術祭 アート部門 新人賞 (文部科学大臣賞) を受賞。 現在はSRE(サイト信頼性エンジニア)として生計をたててている。

技術

Configuration Management Terraform, Ansible, Cloud-Init
Cloud Platform GCP, AWS, Azure, OpenStack
Virtualization, Container QEMU+KVM, Proxmox, Xen, LXD/LXC, Docker, Kata, systemd-nspawn
OS, Distribution Debian GNU/Linux, Ubuntu, CentOS, FreeBSD, macOS, ...
Storage Ceph, GlusterFS, ZFS, Btrfs, ...
Router Linux+Netfilter, Quagga, FRR, VyOS, Cisco IOS, YAMAHA RTX, ...
Switch Dell FTOS, AlaxalA, NETGEAR, ...
SQL MySQL, MariaDB(Galera Cluster), PostgreSQL, BigQuery, ...
NoSQL Elasticsearch, InfluxDB, etcd, MongoDB, ...
WebApps WordPress, GitLab, Redmine, ...
Monitoring Grafana, Prometheus, Nagios, Munin, Zabbix
DNS CoreDNS, dnsmasq, Unbound, BIND9, ...
Misc Kubernetes/Istio, certbot, HAProxy, ...

自称はネットワークエンジニアだが、 Linuxのネットワークと仮想化技術が得意なため、 サーバエンジニアの雰囲気のほうが強いかもしれない。

習得中

Virtualization, Container, OS VirtIO GPU, okd, CDH, CoreOS, ...
Network mVPN, Calico, IoT(6LoWPAN, LoRaWAN), ...
NoSQL BigTable, HBase, OpenTSDB, Redis, ...
Misc Test Engineering, Android Apps, ...

大きな領域では、セキュリティを考慮した複数パブリッククラウドの相互運用に興味がある。

投稿

MATLAB形式のファイルをpythonで読み込む

概要

MATLABのデータをnumpyで利用したかったので、scipyで読み込んでみた。

Octaveでデータの作成

MATLABが手元になかったので、Octaveでm.matを作成。

$ octave -q
octave:1> m = zeros(8, 8)
m =

   0   0   0   0   0   0   0   0
   0   0   0   0   0   0   0   0
   0   0   0   0   0   0   0   0
   0   0   0   0   0   0   0   0
   0   0   0   0   0   0   0   0
   0   0   0   0   0   0   0   0
   0   0   0   0   0   0   0   0
   0   0   0   0   0   0   0   0

octave:2> m(3:6, 3:6) = 1
m =

   0   0   0   0   0   0   0   0
   0   0   0   0   0   0   0   0
   0   0   1   1   1   1   0   0
   0   0   1   1   1   1   0   0
   0   0   1   1   1   1   0   0
   0   0   1   1   1   1   0   0
   0   0   0   0   0   0   0   0
   0   0   0   0   0   0   0   0

octave:3> save data.mat m -mat
octave:4> save data.txt m

ちなみに -mat オプションを付けない場合はテキストデータなので、コンソールで読める。

$ cat data.txt
# Created by Octave 4.2.1, Fri Dec 08 01:32:35 2017 JST <user@hostname>
# name: m
# type: matrix
# rows: 8
# columns: 8
 0 0 0 0 0 0 0 0
 0 0 0 0 0 0 0 0
 0 0 1 1 1 1 0 0
 0 0 1 1 1 1 0 0
 0 0 1 1 1 1 0 0
 0 0 1 1 1 1 0 0
 0 0 0 0 0 0 0 0
 0 0 0 0 0 0 0 0

scipyでMATLAB形式のデータを読み込み

scipy.ioを使用しdata.matを読みこむ。

$ ipython
Python 3.6.1 (v3.6.1:69c0db5050, Mar 21 2017, 01:21:04)
Type 'copyright', 'credits' or 'license' for more information
IPython 6.2.1 -- An enhanced Interactive Python. Type '?' for help.

In [1]: import scipy.io

In [2]: data = scipy.io.loadmat("data.mat")

In [3]: type(data["m"])
Out[3]: numpy.ndarray

In [4]: data["m"]
Out[4]:
array([[ 0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.],
       [ 0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.],
       [ 0.,  0.,  1.,  1.,  1.,  1.,  0.,  0.],
       [ 0.,  0.,  1.,  1.,  1.,  1.,  0.,  0.],
       [ 0.,  0.,  1.,  1.,  1.,  1.,  0.,  0.],
       [ 0.,  0.,  1.,  1.,  1.,  1.,  0.,  0.],
       [ 0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.],
       [ 0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.]])

↑のようにして読み込むことができた。

scipyでMATLAB形式のデータを書き込み

逆に書き込むこともできる。 行列データmの中身をすべて-1したものをdata-1.matとして書き込む。

In [5]: data["m"] = data["m"] - 1

In [6]: data["m"]
Out[6]:
array([[-1., -1., -1., -1., -1., -1., -1., -1.],
       [-1., -1., -1., -1., -1., -1., -1., -1.],
       [-1., -1.,  0.,  0.,  0.,  0., -1., -1.],
       [-1., -1.,  0.,  0.,  0.,  0., -1., -1.],
       [-1., -1.,  0.,  0.,  0.,  0., -1., -1.],
       [-1., -1.,  0.,  0.,  0.,  0., -1., -1.],
       [-1., -1., -1., -1., -1., -1., -1., -1.],
       [-1., -1., -1., -1., -1., -1., -1., -1.]])

In [7]: scipy.io.savemat("data-1.mat", data)

OctaveでMATLAB形式のデータを読み込み

上記でscipyによって作成したdata-1.matをOctaveで読み込む。

$ octave -q
octave:1> load data-1.mat m -mat
octave:2> m
m =

  -1  -1  -1  -1  -1  -1  -1  -1
  -1  -1  -1  -1  -1  -1  -1  -1
  -1  -1   0   0   0   0  -1  -1
  -1  -1   0   0   0   0  -1  -1
  -1  -1   0   0   0   0  -1  -1
  -1  -1   0   0   0   0  -1  -1
  -1  -1  -1  -1  -1  -1  -1  -1
  -1  -1  -1  -1  -1  -1  -1  -1

読み込めた。 めでたしめでたし。

参考